RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SAMM50Q9Y512 469 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 A0A087WWV3 80 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 POTEB3A0JP26 581 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 YEATS4O95619 227 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 INSRRP14616 1297 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PSMC5P62195 406 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PRKCEQ02156 737 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 CYP4A11Q02928 519 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 POTEBQ6S5H4 581 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 C4orf19Q8IY42 314 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LXNQ9BS40 222 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 AZI2Q9H6S1 392 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 OATP04181 439 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ITGB8P26012 769 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 RPA1P27694 616 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 HYIQ5T013 277 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PNMA5Q96PV4 448 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 CSRNP2Q9H175 543 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TBX21Q9UL17 535 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SPTLC2O15270 562 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TREHO43280 583 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 HBP1O60381 514 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PPP6R2O75170 966 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 CHMP4BP1P59074 171 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 GRB10Q13322 594 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 GRIK4Q16099 956 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 XKR3Q5GH77 459 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TPH2Q8IWU9 490 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 C7orf31Q8N865 590 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 EPSTI1Q96J88 318 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 NRCAMQ92823 1304 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 LTBP2Q14767 1821 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS1-204ENST00000484893 SIP14410 1827 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 C22orf31O95567 290 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 CYP2C9P11712 490 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 NPEPPSP55786 919 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 PPFIA1Q13136 1202 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 PTGISQ16647 500 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 SPECC1Q5M775 1068 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 POTEGQ6S5H5 508 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 KCNK18Q7Z418 384 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 SERINC5Q86VE9 423 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 NEK9Q8TD19 979 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 VWCEQ96DN2 955 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 AK8Q96MA6 479 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 COL1A2P08123 1366 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 A0A087X0B3 334 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 KIAA0355O15063 1070 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 MUTP22033 750 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 RBL2Q08999 1139 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 GPNMBQ14956 572 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 STK38Q15208 465 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS1-204ENST00000484893 SHC4Q6S5L8 630 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms