RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-208ENST00000483670 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 CALCRLQ16602 461 aa29.09■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 HAS1Q92839 578 aa29.09■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 GJA10Q969M2 543 aa29.09■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 SCN5AQ14524 2016 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 RSPH10B2B2RC85 870 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 H3BQV1 296 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 RSPH10BP0C881 870 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 IGBP1P78318 339 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 MARCH8Q5T0T0 291 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF618Q5T7W0 954 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 HERVK_113Q902F9 699 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 WNT8BQ93098 351 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 VAV3Q9UKW4 847 aa29.08■■■□□ 2.25
PDCD4-208ENST00000483670 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 NRBP2Q9NSY0 501 aa29.07■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.07■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 LAMA3Q16787 3333 aa29.07■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 RASIP1Q5U651 963 aa29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 GPR153Q6NV75 609 aa29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 SNX21Q969T3 373 aa29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.06■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 CXCL10P02778 98 aa29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 OATP04181 439 aa29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 ATP4AP20648 1035 aa29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 PDCP20941 246 aa29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 TRAF7Q6Q0C0 670 aa29.05■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 BAIAP3O94812 1187 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 PRKCEQ02156 737 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 FAM26DQ5JW98 314 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 MTHFD1LQ6UB35 978 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 NME8Q8N427 588 aa29.04■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 ATP2B1P20020 1258 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 MCM7P33993 719 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 PSMC5P62195 406 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 XKR3Q5GH77 459 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 TTC38Q5R3I4 469 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 MCTP1Q6DN14 999 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 VWCEQ96DN2 955 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 MTMR9Q96QG7 549 aa29.03■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 KIF28PB7ZC32 967 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 MAGEB2O15479 319 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF862O60290 1169 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 P4HBP07237 508 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 KLRC1P26715 233 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 EPHA7Q15375 998 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 IER5Q5VY09 327 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PDCD4-208ENST00000483670 NBNO60934 754 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 EFCAB14O75071 495 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 QARSP47897 775 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 SPIRE1Q08AE8 756 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 RILPL1Q5EBL4 403 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.01■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 TET1Q8NFU7 2136 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 ZBTB42B2RXF5 422 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 M0QZ92 97 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 EML1O00423 815 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 WNT7AO00755 349 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 CTSHP09668 335 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 TXKP42681 527 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 GPNMBQ14956 572 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 UGCGQ16739 394 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 HSCBQ8IWL3 235 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 NEK9Q8TD19 979 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 MBTPS1Q14703 1052 aa28.99■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.99■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 ZBBXA8MT70 800 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 C22orf31O95567 290 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 OR52Z1P0C646 297 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF174Q15697 407 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 BANK1Q8NDB2 785 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 PPME1Q9Y570 386 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 SQORQ9Y6N5 450 aa28.98■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.97■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 LAD1O00515 517 aa28.97■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 TMOD1P28289 359 aa28.97■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 IKBKEQ14164 716 aa28.97■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PDCD4-208ENST00000483670 C4orf19Q8IY42 314 aa28.97■■■□□ 2.23
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