RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 TREML2Q5T2D2 321 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 NSMFQ6X4W1 530 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 REPS2Q8NFH8 660 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 HPS3Q969F9 1004 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CALML4Q96GE6 196 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf42Q96LP6 360 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 AK8Q96MA6 479 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 IFNKQ9P0W0 207 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.86□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RPTORQ8N122 1335 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MYMKA6NI61 221 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 C19orf81C9J6K1 198 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 E9PMD0 336 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MEIS1O00470 390 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PSMC6P62333 389 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ASIC1P78348 528 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 FANCCQ00597 558 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MYL5Q02045 173 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 KRT79Q5XKE5 535 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MCTP2Q6DN12 878 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SARM1Q6SZW1 724 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 DYMQ7RTS9 669 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 DRC7Q8IY82 874 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MLKLQ8NB16 471 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RAD54LQ92698 747 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 GSDMAQ96QA5 445 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RNF146Q9NTX7 359 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 VAV3Q9UKW4 847 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CSADQ9Y600 493 aa6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 WDR81Q562E7 1941 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SMTNL1A8MU46 457 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 IKBKBO14920 756 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB39O15060 712 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CHMP2AO43633 222 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PSMD10O75832 226 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ADH1AP07327 375 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 FCER1AP12319 257 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ITGB5P18084 799 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PRCPP42785 496 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ERVK-9P63128 1117 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CYP4A11Q02928 519 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 TRAF1Q13077 416 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 PLS1Q14651 629 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 COG2Q14746 738 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SV2BQ7L1I2 683 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.84□□□□□ -1.31
SKAP2-204ENST00000481204 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms