RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQ64 194 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQD8 194 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZBBXA8MT70 800 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZBTB43O43298 467 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RGS20O76081 388 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FGBP02675 491 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 POLR2MP0CAP2 368 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MYOGP15173 224 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SP2Q02086 613 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GRIN2CQ14957 1233 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RNF214Q8ND24 703 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KAT2BQ92831 832 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 VWCEQ96DN2 955 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.09□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TCHHQ07283 1943 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GGPS1O95749 300 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CCND2P30279 289 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SP4Q02446 784 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TRIM29Q14134 588 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PTGISQ16647 500 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 UBE2SQ16763 222 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 APOA5Q6Q788 366 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MICU3Q86XE3 530 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPM1EQ8WY54 764 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TIFAQ96CG3 184 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PBX4Q9BYU1 374 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DACT1Q9NYF0 836 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 USP25Q9UHP3 1055 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NOD1Q9Y239 953 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.08□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DLL1O00548 723 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TLL1O43897 1013 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 KINO60870 393 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DDAH1O94760 285 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TYRO3Q06418 890 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DGKDQ16760 1214 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RASIP1Q5U651 963 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ADALQ6DHV7 355 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HERVK_113Q902F9 699 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SPATA33Q96N06 139 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PRR14Q9BWN1 585 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZNF576Q9H609 170 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CALM1P0DP23 149 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CALM2P0DP24 149 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CALM3P0DP25 149 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 IFNAR1P17181 557 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LIG1P18858 919 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KIF5BP33176 963 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GHRHRQ02643 423 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.06□□□□□ -1.28
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