RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.67□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 SHBGP04278 402 aa14.67□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 ADCY2Q08462 1091 aa14.67□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 LRRC41Q15345 812 aa14.67□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.66□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 SNX3O60493 162 aa14.66□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PMS2P54278 862 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PPP2R5EQ16537 467 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 GALNTL6Q49A17 601 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DENND2CQ68D51 928 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 RAD54LQ92698 747 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DDX12PQ92771 950 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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SRPRB-201ENST00000466490 PDE6CP51160 858 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CCNG1P51959 295 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 BLMHQ13867 455 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ECT2Q9H8V3 914 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.66□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CYTH3O43739 400 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ANXA13P27216 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PEX19P40855 299 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DUPD1Q68J44 220 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 RNF217Q8TC41 542 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 HES6Q96HZ4 224 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TXKP42681 527 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 NPEPPSP55786 919 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CHRNDQ07001 517 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PTPROQ16827 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 SBK1Q52WX2 424 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DAAM2Q86T65 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 AZI2Q9H6S1 392 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TLDC2A0PJX2 215 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 FLOT1O75955 427 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 EPS15P42566 896 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PTENP60484 403 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 COPS2P61201 443 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 BNIP1Q12981 228 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF384Q8TF68 577 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 IFT74Q96LB3 600 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ERP44Q9BS26 406 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 MTFR1LQ9H019 292 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRPRB-201ENST00000466490 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GNA11P29992 359 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NT5C2P49902 561 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KLHL29Q96CT2 875 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GOPCQ9HD26 462 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 C6orf50Q9HD87 102 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 INTUQ9ULD6 942 aa14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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