RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	E2F7	Q96AV8	911 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CYP17A1	P05093	508 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF28	P17035	718 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SOX5	P35711	763 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KCNC1	P48547	511 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SCNN1B	P51168	640 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SLURP1	P55000	103 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	IGBP1	P78318	339 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SEC23A	Q15436	765 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	NME9	Q86XW9	330 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	WDR48	Q8TAF3	677 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	MTFR1L	Q9H019	292 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GTL3	188 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FAM83G	A6ND36	823 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MME	P08473	750 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CNGA1	P29973	690 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	STAT3	P40763	770 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GJA9	P57773	515 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ANAPC15	P60006	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	DSG1	Q02413	1049 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GBP4	Q96PP9	640 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM13	O60858	407 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	BMP7	P18075	431 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IL13	P35225	146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GLRB	P48167	497 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	AMPD3	Q01432	767 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RTP5	Q14D33	572 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	USP40	Q9NVE5	1235 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	OXSM	Q9NWU1	459 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454		H0Y858	1186 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KNG1	P01042	644 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MC4R	P32245	332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	EPHA7	Q15375	998 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	DHCR24	Q15392	516 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RGL3	Q3MIN7	710 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RNF180	Q86T96	592 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf74	Q86VG3	221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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