RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 USP25Q9UHP3 1055 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 SMTNL1A8MU46 457 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 HAS3O00219 553 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 SPTLC1O15269 473 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 DGKIO75912 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 MCCP23508 829 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 EDNRBP24530 442 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ITIH3Q06033 890 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TDGQ13569 410 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-210ENST00000441703 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TSC1Q92574 1164 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 BORCS6Q96GS4 357 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 LNPKQ9C0E8 428 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 AAASQ9NRG9 546 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TREHO43280 583 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ADCY5O95622 1261 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PROS1P07225 676 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 STAG3L1P0CL83 205 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TSPY3P0CV98 308 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TSPY8P0CW00 308 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ARP10275 920 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GHRP10912 638 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GNAT1P11488 350 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CUL4AQ13619 759 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 LAMC2Q13753 1193 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC96Q2M329 555 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CEP85Q6P2H3 762 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 KRT222Q8N1A0 295 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.37□□□□□ -1.23
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HDAC6-210ENST00000441703 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PPTC7Q8NI37 304 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 NETO1Q8TDF5 533 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 YY1AP1Q9H869 796 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CDH22Q9UJ99 828 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PNMA2Q9UL42 364 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 MTMR7Q9Y216 660 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 TTC3P53804 2025 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ENPP3O14638 875 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 SLC30A4O14863 429 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 EOMESO95936 686 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CHGBP05060 677 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CFHP08603 1231 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CA8P35219 290 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ERVFC1P60507 584 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 HIC1Q14526 733 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC6-210ENST00000441703 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.36□□□□□ -1.23
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