RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, humanhuman

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPB-204ENST00000438490 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L15C9J2P7 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L11C9JVI0 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L18D6R9N7 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L22D6RA61 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L19D6RCP7 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L20D6RJB6 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CES2O00748 559 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MEIS2O14770 477 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GAP43P17677 238 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 RPA1P27694 616 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SLC1A4P43007 532 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 ARHGAP4P98171 946 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L24Q0WX57 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SLC15A2Q16348 729 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 FBXO11Q86XK2 927 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 RCCD1A6NED2 376 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 PDXKO00764 312 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 ZNF263O14978 683 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CETN3O15182 167 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GFPT2O94808 682 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 IDEP14735 1019 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MAGEA1P43355 309 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 KLK7P49862 253 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GUCA2AQ02747 115 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 TCEAL1Q15170 157 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 HGSNATQ68CP4 663 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 DYMQ7RTS9 669 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GPBP1Q86WP2 473 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 EPC1Q9H2F5 836 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 TUFT1Q9NNX1 390 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 PNMA2Q9UL42 364 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CALUO43852 315 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CREB3O43889 395 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 RPS6KA5O75582 802 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 VSNL1P62760 191 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 ICA1Q05084 483 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 JDP2Q8WYK2 163 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CNKSR1Q969H4 720 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GANQ9H2C0 597 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 TRIM10Q9UDY6 481 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.04□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 LRRC53A6NM62 1247 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 TRAF5O00463 557 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 EYA4O95677 639 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 PAX3P23760 479 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 NFIAQ12857 509 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 NNTQ13423 1086 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 NCOA4Q13772 614 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 CASP8Q14790 479 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 DOK7Q18PE1 504 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 WDR78Q5VTH9 848 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 KCTD1Q719H9 257 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 SCFD1Q8WVM8 642 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 LENG9Q96B70 501 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MMS19Q96T76 1030 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 DNM3Q9UQ16 869 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 F5H6K3 240 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 F8W031 263 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 AKR1B10O60218 316 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 MED24O75448 989 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 NOL4O94818 638 aa5.03□□□□□ -1.6
RALGAPB-204ENST00000438490 FDX1P10109 184 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms