RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428650.5

STRC-201, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 5,386 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-201ENST00000428650 CHRNA3P32297 505 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MCAMP43121 646 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GPC5P78333 572 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GUCY2CP25092 1073 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DRP2Q13474 957 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 DOK7Q18PE1 504 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KCTD1Q719H9 257 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ORC4O43929 436 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ATP1A3P13637 1013 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TNFAIP2Q03169 654 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RAPH1Q70E73 1250 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FDX1P10109 184 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NPR1P16066 1061 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ITKQ08881 620 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PLAAQ9Y263 795 aa15.47■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CLIC2O15247 247 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 IGBP1P78318 339 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 AP3M2P53677 418 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PPP2R5CQ13362 524 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 KLC2Q9H0B6 622 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PRELPP51888 382 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 ZBTB17Q13105 803 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 TIPINQ9BVW5 301 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 LY9Q9HBG7 655 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.46■□□□□ 0.07
STRC-201ENST00000428650 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 SULF1Q8IWU6 871 aa15.46■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 COA7Q96BR5 231 aa15.46■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 ABCB11O95342 1321 aa15.46■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 FGGP02679 453 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 PYGBP11216 843 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 SFNP31947 248 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 KIF22Q14807 665 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CYP26B1Q9NR63 512 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 MADDQ8WXG6 1647 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CFAP73A6NFT4 308 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 LRRN2O75325 713 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 KRT38O76015 456 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 FSCBQ5H9T9 825 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 KLC3Q6P597 504 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TAP1Q03518 808 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 NFU1Q9UMS0 254 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CHUKO15111 745 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 SMIM24O75264 130 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.45■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 PALMO75781 387 aa15.44■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 USP17L8P0C7I0 530 aa15.44■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
STRC-201ENST00000428650 TAF11Q15544 211 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms