RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 REC8O95072 547 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CCNE2O96020 404 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PKN1Q16512 942 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 POTEBQ6S5H4 581 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 NME8Q8N427 588 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 COL1A2P08123 1366 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TTC3P53804 2025 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 M0QZ92 97 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PSMA5P28066 241 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 GNA11P29992 359 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 EVCP57679 992 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FIBCD1Q8N539 461 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 HBP1O60381 514 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 RB1P06400 928 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00271P0C7V0 271 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 GPM6BQ13491 265 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 NTRK3Q16288 839 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.86■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CD52P31358 61 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 BICD2Q8TD16 824 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 DGKIO75912 1065 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 IFNAR1P17181 557 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CIITAP33076 1130 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 COL19A1Q14993 1142 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF302Q9NR11 478 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.84■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 BACH1O14867 736 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PAK2Q13177 524 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 BANK1Q8NDB2 785 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PHKBQ93100 1093 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PADI3Q9ULW8 664 aa23.83■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS3O15072 1205 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 KLRC1P26715 233 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNB1P35222 781 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 BMPR1AP36894 532 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 KRT76Q01546 638 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PLVAPQ9BX97 442 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 RUFY3Q7L099 469 aa23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 NEK9Q8TD19 979 aa23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 ATP4AP20648 1035 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 LENG9Q96B70 501 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.8■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 STAG3L1P0CL83 205 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 KCNA5P22460 613 aa23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms