RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 GPRASP2Q96D09 838 aa17.02■□□□□ 0.32
CITED1-204ENST00000427412 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CITED1-204ENST00000427412 TBC1D32Q96NH3 1257 aa17.02■□□□□ 0.32
CITED1-204ENST00000427412 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.02■□□□□ 0.32
CITED1-204ENST00000427412 V9GY48 417 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CITED1-204ENST00000427412 GHRP10912 638 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 NAPAP54920 295 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 EVCP57679 992 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 FUT2Q10981 343 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SCRN1Q12765 414 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 LPIN1Q14693 890 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 USP17L6PQ6QN14 398 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 RUFY4Q6ZNE9 571 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 NLRX1Q86UT6 975 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 NECAB1Q8N987 351 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CLDND1Q9NY35 253 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 EVPLQ92817 2033 aa17.01■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 GRM6O15303 877 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MMP1P03956 469 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 BMPR1AP36894 532 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SP4Q02446 784 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PPFIA1Q13136 1202 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 RABEP1Q15276 862 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 FBXO47Q5MNV8 452 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 KMT2EQ8IZD2 1858 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CUL5Q93034 780 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CDHR1Q96JP9 859 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 KCNH6Q9H252 994 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TUBE1Q9UJT0 475 aa17■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 HYAL1Q12794 435 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 GRIK4Q16099 956 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 UBE2SQ16763 222 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ME3Q16798 604 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PLVAPQ9BX97 442 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.99■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PFKFB2O60825 505 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ATP9AO75110 1047 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TBX10O75333 385 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 DGKIO75912 1065 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SCG2P13521 617 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 IFNAR1P17181 557 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ITGB5P18084 799 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 IRS1P35568 1242 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 NTRK3Q16288 839 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 RSPH3Q86UC2 560 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 P2RX5Q93086 422 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SQORQ9Y6N5 450 aa16.98■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 STXBP3O00186 592 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ENPP3O14638 875 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MBTPS2O43462 519 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ST18O60284 1047 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 FOSBP53539 338 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 GTF3C6Q969F1 213 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CDKL5O76039 1030 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MARK3P27448 753 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 ADCY7P51828 1080 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CAMK1Q14012 370 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 BARHL2Q9NY43 387 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED1-204ENST00000427412 USP34Q70CQ2 3546 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED1-204ENST00000427412 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED1-204ENST00000427412 MTMR1Q13613 665 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED1-204ENST00000427412 PKN1Q16512 942 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED1-204ENST00000427412 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms