RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 HAS1Q92839 578 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DNM1LO00429 736 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF844Q08AG5 666 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.04■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PMD0 336 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 LDHCP07864 332 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ELF1P32519 619 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CUL1Q13616 776 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SNCBQ16143 134 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH4Q9Y623 1939 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK3O14649 394 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TMOD1P28289 359 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 BIRC3Q13489 604 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FUKQ8N0W3 1084 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC45Q96CN5 670 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.03■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CES2O00748 559 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SP8Q8IXZ3 490 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF4BQ92750 862 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP63Q96MT8 703 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTN1P12814 892 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NF2P35240 595 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM228AQ86W67 206 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.02■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 C5orf60A6NFR6 353 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH6O60337 910 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 EPS15P42566 896 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP2R2AP63151 447 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PTK2Q05397 1052 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 ASIC2Q16515 512 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SCFD2Q8WU76 684 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 GANQ9H2C0 597 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 LTBP1Q14766 1721 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2IP78347 998 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KA1Q15418 735 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF5Q92565 580 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.01■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PAEPP09466 180 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNH2Q12809 1159 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM9Q13443 819 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 ODF2Q5BJF6 829 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SGSM3Q96HU1 749 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEB3A0JP26 581 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCO5BA8MYB1 307 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 POTECB2RU33 542 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 GNA14O95837 355 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SCTRP47872 440 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MARSP56192 900 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEBQ6S5H4 581 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEC3Q8TD91 643 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MXD3Q9BW11 206 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 AP1M1Q9BXS5 423 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL5Q9UKA1 691 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.99■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF4AO95239 1232 aa19.99■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 NOVP48745 357 aa19.99■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 RHBDL3P58872 404 aa19.99■□□□□ 0.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT2Q15019 361 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms