RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	ADCY6	O43306	1168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC34A2	O95436	690 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PRKCE	Q02156	737 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	STX1A	Q16623	288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	HTT	P42858	3142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	BIN1	O00499	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF862	O60290	1169 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CYBA	P13498	195 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ELN	P15502	786 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ASIC1	P78348	528 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PCYT2	Q99447	389 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB39	O15060	712 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ADCY3	O60266	1144 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LGR5	O75473	907 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	HMGCR	P04035	888 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	AKR1A1	P14550	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP11B2	P19099	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DDX12P	Q92771	950 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	KLRC4	O43908	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	STBD1	O95210	358 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	OAT	P04181	439 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RARRES1	P49788	294 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	STAT5B	P51692	787 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PRMT2	P55345	433 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NLRP12	P59046	1061 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM32	Q13049	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MORC3	Q14149	939 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ANO5	Q75V66	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GLG1	Q92896	1179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CENPF	P49454	3210 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LGALS2	P05162	132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MMP3	P08254	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP4A	P20648	1035 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNB1	Q14721	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms