RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNQ2O43526 872 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HMGCRP04035 888 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF20P17024 532 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SELENOPP49908 381 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP10-2P60368 255 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HIPK4Q8NE63 616 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UBXN4Q92575 508 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCYL1Q96KG9 808 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LMF1Q96S06 567 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MSL2Q9HCI7 577 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GALNT8Q9NY28 637 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ESYT3A0FGR9 886 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNK3O14649 394 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FOXP2O15409 715 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SDHAP31040 664 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MC4RP32245 332 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGFALSP35858 605 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAC3P60763 192 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IL13RA1P78552 427 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IRF9Q00978 393 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAP3K12Q12852 859 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM177Q53S58 311 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HS1BP3Q53T59 392 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CALML6Q8TD86 181 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BOCQ9BWV1 1114 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTBD2Q9BX70 525 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR10A5Q9H207 317 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DEF6Q9H4E7 631 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BTBD7Q9P203 1132 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 JAG2Q9Y219 1238 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ASB1Q9Y576 335 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PATE3B3GLJ2 98 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MUSKO15146 869 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR42O15529 346 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMEP08473 750 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INSRRP14616 1297 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FLT3P36888 993 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ECE1P42892 770 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MEOX1P50221 254 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RRADP55042 308 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STILQ15468 1287 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARHGAP44Q17R89 818 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGSF22Q8N9C0 903 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNERQ8NFT8 737 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ASB15Q8WXK1 588 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 E2F7Q96AV8 911 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCLYQ96I15 445 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WNK4Q96J92 1243 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DRC1Q96MC2 740 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GBP4Q96PP9 640 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CABP5Q9NP86 173 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NR2E1Q9Y466 385 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A0G2JNJ9 132 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OPA1O60313 960 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF623O75123 536 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ASLP04424 464 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADCY8P40145 1251 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FNTBP49356 437 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNQ1P51787 676 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ICAM4Q14773 271 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KANK2Q63ZY3 851 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms