RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.82■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.81■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 RETREG2Q8NC44 543 aa26.81■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.79■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 PSMC5P62195 406 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 RBL2Q08999 1139 aa26.79■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 RGL1Q9NZL6 768 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.78■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 DYDC2Q96IM9 177 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 COL1A2P08123 1366 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM150BA6NC51 233 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.77■■□□□ 1.88
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UBE2E3-202ENST00000410062 SELPP16109 830 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 KLRC1P26715 233 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 MTHFD1LQ6UB35 978 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
UBE2E3-202ENST00000410062 STBD1O95210 358 aa26.76■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.75■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.75■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.75■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 IL23AQ9NPF7 189 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.75■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TPH2Q8IWU9 490 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 VWCEQ96DN2 955 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 C22orf31O95567 290 aa26.74■■□□□ 1.87
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UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 BECN1Q14457 450 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 GPNMBQ14956 572 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 IL17AQ16552 155 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 MTERF2Q49AM1 385 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ANO5Q75V66 913 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TDHQ8IZJ6 230 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 EVPLQ92817 2033 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 RSPH10BP0C881 870 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 MBTPS1Q14703 1052 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF365Q70YC5 407 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 C4orf19Q8IY42 314 aa26.72■■□□□ 1.87
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