RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-205ENST00000409985 GANQ9H2C0 597 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-205ENST00000409985 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-205ENST00000409985 CLRN2A0PK11 232 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POTEFA5A3E0 1075 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ZNF185O15231 689 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POTEIP0CG38 1075 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PAFAH1B1P43034 410 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NAB2Q15742 525 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POTEGQ6S5H5 508 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 EYA4O95677 639 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 GAP43P17677 238 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF8P28908 595 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 STAT3P40763 770 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NFIL3Q16649 462 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 VAV3Q9UKW4 847 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 CLSTN1O94985 981 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NR2F2P24468 414 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 KCNH2Q12809 1159 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 OLFML3Q9NRN5 406 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 FAM86B1E9PN63 330 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TLR10Q9BXR5 811 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SCN4AP35499 1836 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 MSH4O15457 936 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 REEP2Q9BRK0 252 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 VPS18Q9P253 973 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 FAM196BA6NMK8 535 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 CES2O00748 559 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 RAD21O60216 631 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ASIC2Q16515 512 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 HACL1Q9UJ83 578 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 GRID2IPA4D2P6 1211 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 OPLAHO14841 1288 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SLURP2P0DP57 97 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 CCDC181Q5TID7 509 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 CCDC102AQ96A19 550 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SALL4Q9UJQ4 1053 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KA5O75582 802 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SFR1Q86XK3 245 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 ERICH4A6NGS2 130 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G6O60733 806 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POTEJP0CG39 1038 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 EPHX2P34913 555 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PRKCIP41743 596 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PSMC6P62333 389 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 C2orf54Q08AI8 447 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA5Q8TBA6 731 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-205ENST00000409985 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GH2P01242 217 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 HOXD13P35453 343 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RRAGCQ9HB90 399 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 UBE4BO95155 1302 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CNTNAP1P78357 1384 aa26.07■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GDF11O95390 407 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.06■■□□□ 1.76
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