RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399211.7

KRT17P1-201, Transcript of keratin 17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene KRT17P1, Length 1,546 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17P1-201ENST00000399211 RETREG2Q8NC44 543 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 MTMR9Q96QG7 549 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 THPOP40225 353 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 BANK1Q8NDB2 785 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 IL23AQ9NPF7 189 aa23.03■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 HBP1O60381 514 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 SELPP16109 830 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 TXKP42681 527 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 PRKCEQ02156 737 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 TMEM240Q5SV17 173 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 RDM1Q8NG50 284 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.02■■□□□ 1.28
KRT17P1-201ENST00000399211 TMEM150BA6NC51 233 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 CTSHP09668 335 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 MBTPS1Q14703 1052 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 ZNF365Q70YC5 407 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SIP14410 1827 aa23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 A0A1W2PPC1 479 aa23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RRN3P2A6NIE6 340 aa23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TRAPPC10P48553 1259 aa23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 PCDHA12Q9UN75 941 aa23■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 EVPLQ92817 2033 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 NBNO60934 754 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 STBD1O95210 358 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 OATP04181 439 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RGL1Q9NZL6 768 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 POTEMA6NI47 508 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SYT1P21579 422 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 KLRC1P26715 233 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 FERMT3Q86UX7 667 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 OR52Z1P0C646 297 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 EPHA7Q15375 998 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TCTN1Q2MV58 587 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 DYDC2Q96IM9 177 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 COL1A2P08123 1366 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RSPH10BP0C881 870 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 PSMC5P62195 406 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 CYP4A11Q02928 519 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 FAM167AQ96KS9 214 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 C22orf31O95567 290 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 FGBP02675 491 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 RFC2P35250 354 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TECP42680 631 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 PTGDRQ13258 359 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 LXNQ9BS40 222 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
KRT17P1-201ENST00000399211 SZT2Q5T011 3432 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 CHRNA1P02708 482 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 PDCP20941 246 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 MGAT3Q09327 533 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 ZBTB39O15060 712 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 CXCL10P02778 98 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
KRT17P1-201ENST00000399211 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms