RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 AGBL4Q5VU57 503 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 WDR48Q8TAF3 677 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR14A2Q96R54 314 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 INCENPQ9NQS7 918 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 GALNT8Q9NY28 637 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 OVOL3O00110 214 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ARVCFO00192 962 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDPK1O15530 556 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ADCY3O60266 1144 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF202O95125 648 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 APPP05067 770 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PYGMP11217 842 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDE6AP16499 860 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRT15P19012 456 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 GABREP78334 506 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 IL13RA1P78552 427 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PTH1RQ03431 593 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 RASGRF1Q13972 1273 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CRY1Q16526 586 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MTERF2Q49AM1 385 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CSRNP2Q9H175 543 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 AMY2AP04746 511 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 AMY2BP19961 511 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ADCY8P40145 1251 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 KCNQ1P51787 676 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 TGFB2P61812 414 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 FHL2Q14192 279 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 STILQ15468 1287 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPATC1Q76KD6 591 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 OSTM1Q86WC4 334 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF503Q96F45 646 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 BTBD2Q9BX70 525 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 BTBD7Q9P203 1132 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CBLCQ9ULV8 474 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ACRV1P26436 265 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MC4RP32245 332 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MCM7P33993 719 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MEOX1P50221 254 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 JAM2P57087 298 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 DUSP8Q13202 625 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCOLCEQ15113 449 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM209AQ5JX71 171 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 Q6ZSN1 163 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 USP30Q70CQ3 517 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 WNK4Q96J92 1243 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 NBPF4Q96M43 638 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR10A2Q9H208 303 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-890P-201ENST00000384121 A0A0G2JNJ9 132 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 CCDC66A2RUB6 948 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 MATN2O00339 956 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 MPIG6BO95866 241 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 ECE1P42892 770 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 DNM2P50570 870 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 HHEXQ03014 270 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 TBR1Q16650 682 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 AMER2Q8N7J2 671 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 EXTL1Q92935 676 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR10A5Q9H207 317 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 NELFAQ9H3P2 528 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 SMURF1Q9HCE7 757 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms