RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 LPIN1Q14693 890 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ATG7O95352 703 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TOP1MTQ969P6 601 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ATP8B4Q8TF62 1192 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SAMM50Q9Y512 469 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 HBP1O60381 514 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 LPXNO60711 386 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 DEXIO95424 95 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 KRT76Q01546 638 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 TRANK1O15050 2925 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 AAK1Q2M2I8 961 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 PSAPP07602 524 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 CD52P31358 61 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 SAMD11Q96NU1 681 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 GINS2Q9Y248 185 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 COL1A2P08123 1366 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 KLRC1P26715 233 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 CIITAP33076 1130 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 TFF2Q03403 129 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 PAK2Q13177 524 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 VCANP13611 3396 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 CDKL5O76039 1030 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 IL17RAQ96F46 866 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 COL4A6Q14031 1691 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 EPC2Q52LR7 807 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 NME8Q8N427 588 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 TBCKQ8TEA7 893 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 COG5Q9UP83 839 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-202ENST00000378546 WDR64B1ANS9 1081 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 CHMP2AO43633 222 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 GAS7O60861 476 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 USP11P51784 963 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 BLIDQ8IZY5 108 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 FIBCD1Q8N539 461 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 LENG9Q96B70 501 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 FTHL17Q9BXU8 183 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 SQORQ9Y6N5 450 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 ENPP3O14638 875 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 PTPROQ16827 1216 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM192Q8IY95 271 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 HLA-CQ95604 372 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 AIFM3Q96NN9 605 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 MSH4O15457 936 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 CTNNB1P35222 781 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 METTL13Q8N6R0 699 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 FAM167AQ96KS9 214 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 PADI3Q9ULW8 664 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-202ENST00000378546 TNFRSF10AO00220 468 aa28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms