RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CNTD1Q8N815 330 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MZB1Q8WU39 189 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 RSAD2Q8WXG1 361 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASB15Q8WXK1 588 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 DLL4Q9NR61 685 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 BTBD7Q9P203 1132 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 SHTN1A0MZ66 631 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 RASSF10A6NK89 507 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 KDM1AO60341 852 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 KATNA1O75449 491 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ALDH1L1O75891 902 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CFBP00751 764 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHGBP05060 677 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MMEP08473 750 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MLANAQ16655 118 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 INAVAQ3KP66 663 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ODR4Q5SWX8 454 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTLL6Q8N841 843 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 C7orf31Q8N865 590 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 DTX3Q8N9I9 347 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 HIPK4Q8NE63 616 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 COG1Q8WTW3 980 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 DIRC2Q96SL1 478 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 BTBD2Q9BX70 525 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 INCENPQ9NQS7 918 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 GALNT8Q9NY28 637 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM75PA6NK02 468 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRLP01236 227 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 C8BP07358 591 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTHFD2P13995 350 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATF2P15336 505 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 GLDCP23378 1020 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 STAT5AP42229 794 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDR1P51861 262 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 NEK2P51955 445 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 BCAR1P56945 870 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CAP1Q01518 475 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PFKPQ01813 784 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MOGSQ13724 837 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PROSER1Q86XN7 944 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 KYQ8NBH2 561 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDR48Q8TAF3 677 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTMR8Q96EF0 704 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLIC6Q96NY7 704 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ORAI2Q96SN7 254 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MSRAQ9UJ68 235 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 FBXO10Q9UK96 956 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 NFIBO00712 420 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 GABRDO14764 452 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MPIG6BO95866 241 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 MED14OSP0DP75 135 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBP3P10745 1247 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 ECE1P42892 770 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD56.1-201ENST00000362913 DLG4P78352 724 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms