RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPARAQ07869 468 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERO1AQ96HE7 468 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 FEZ1Q99689 392 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZMYM6O95789 1325 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHMLP26374 656 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP14P54578 494 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ICA1Q05084 483 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 BEND4Q6ZU67 534 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 INCENPQ9NQS7 918 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD18Q9NS91 495 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 CENPFP49454 3210 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV1-40P01703 118 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FGRP09769 529 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 VCAM1P19320 739 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP11P51784 963 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE4BQ07343 736 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAAP100Q0VG06 881 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABHD8Q96I13 439 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEP44Q9C0F1 390 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF112Q9ULX5 631 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMX2Q9Y320 296 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM17Q9Y577 477 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAMA4Q16363 1823 aa8.82□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD50Q92878 1312 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 MGAMO43451 1857 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEX10O60683 326 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADH5P11766 374 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 HAND2P61296 217 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 HERVK_113P62684 666 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFAP4Q01664 338 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF43Q68DV7 783 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEP95Q96GE4 821 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 VCPKMTQ9H867 229 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 NYAP2Q9P242 653 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.81□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 RLFQ13129 1914 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 SGSM2O43147 1006 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ORC4O43929 436 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPY3P0CV98 308 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPY8P0CW00 308 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSMC4P43686 418 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF22Q14807 665 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.8□□□□□ -1
RNU1-38P-201ENST00000362817 LPAR1Q92633 364 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms