RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 JAK3P52333 1124 aa30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 CKAP2LQ8IYA6 745 aa30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 HBP1O60381 514 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 CXCL10P02778 98 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 SFNP31947 248 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB3Q8WWF6 145 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 FAM20AQ96MK3 541 aa30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCEQ02156 737 aa30.42■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 TAF2Q6P1X5 1199 aa30.42■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZBBXA8MT70 800 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 TBX3O15119 743 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R5CQ13362 524 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 MTHFD1LQ6UB35 978 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM60Q9H2L4 133 aa30.41■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 CAND2O75155 1236 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNA1P02708 482 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 MGAT3Q09327 533 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 FAM26DQ5JW98 314 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 Q7L0L9 218 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 RPAINQ86UA6 219 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 BANK1Q8NDB2 785 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 RDM1Q8NG50 284 aa30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM150BA6NC51 233 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 NEMFO60524 1076 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 STBD1O95210 358 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 OATP04181 439 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 KLRC1P26715 233 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 CUL4AQ13619 759 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 NBR1Q14596 966 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa30.39■■■□□ 2.46
TPGS1-201ENST00000359315 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MARCH6O60337 910 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 C22orf31O95567 290 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MCM7P33993 719 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 PBX2P40425 430 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 CALCRLQ16602 461 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF484Q5JVG2 852 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 COL1A2P08123 1366 aa30.38■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM62Q0P6H9 643 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 NCAPH2Q6IBW4 605 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 CNKSR3Q6P9H4 555 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR9Q96QG7 549 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.37■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 ACTN1P12814 892 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF174Q15697 407 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TET1Q8NFU7 2136 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 FAM167AQ96KS9 214 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 SH2D3AQ9BRG2 576 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 PBX4Q9BYU1 374 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 KIF3AQ9Y496 699 aa30.36■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 SZT2Q5T011 3432 aa30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 BAG4O95429 457 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 GHRP10912 638 aa30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TXKP42681 527 aa30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 RABGGTBP53611 331 aa30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TTC38Q5R3I4 469 aa30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa30.34■■■□□ 2.45
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TPGS1-201ENST00000359315 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 SLC34A2O95436 690 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB2P25686 324 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 WDR5P61964 334 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB103AP81534 67 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 LPIN1Q14693 890 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 GPR153Q6NV75 609 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH3Q86UC2 560 aa30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
TPGS1-201ENST00000359315 BAIAP3O94812 1187 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 PSMC5P62195 406 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA7Q15375 998 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 MCTP1Q6DN14 999 aa30.32■■■□□ 2.44
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