RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBX1O43435 398 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPFIA3O75145 1194 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSAPP07602 524 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS6KB1P23443 525 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GGCXP38435 758 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POU5F1BQ06416 359 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCAPHQ15003 741 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRF1Q92994 677 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFKB1P19838 968 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NME2P22392 152 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCM5P33992 734 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HTRA3P83110 453 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MEIOBQ8N635 442 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NECAB1Q8N987 351 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATG4CQ96DT6 458 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEDD4P46934 1319 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH7P12883 1935 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIP5K1CO60331 668 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCD1P51178 756 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP2R2AP63151 447 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFIAQ12857 509 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALX1Q15699 326 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPM1EQ8WY54 764 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMX3Q96JJ7 454 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS33BQ9H267 617 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLF15Q9UIH9 416 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FLT1P17948 1338 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERICH2A1L162 156 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPY2A6NKD2 308 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO1BO43795 1136 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RFPL1O75677 317 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC19A1P41440 591 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE4BQ07343 736 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCINQ13939 588 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRAPQ7Z569 592 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNX21Q969T3 373 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SBF1O95248 1867 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H7C1D1 291 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLURP2P0DP57 97 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARAFP10398 606 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms