RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.73□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TRIM9Q9C026 710 aa6.73□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RGL1Q9NZL6 768 aa6.73□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DACH1Q9UI36 760 aa6.73□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NFASCO94856 1347 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MYMKA6NI61 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 B4DLN1 442 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KCNA2P16389 499 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ICAM3P32942 547 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PSMC6P62333 389 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KCNB1Q14721 858 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MLKLQ8NB16 471 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NEK9Q8TD19 979 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DNM3Q9UQ16 869 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SETSIPP0DME0 302 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 JAK3P52333 1124 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SLC12A3P55017 1021 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ASIC1P78348 528 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KRT76Q01546 638 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SREBF2Q12772 1141 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 E2F5Q15329 346 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TPH2Q8IWU9 490 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 WDR81Q562E7 1941 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 STRNO43815 780 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RHOBTB3O94955 611 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GPR142Q7Z601 462 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MORC4Q8TE76 937 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DRC1Q96MC2 740 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CPA4Q9UI42 421 aa6.72□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 BECN2A8MW95 431 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 EYA4O95677 639 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CCNE2O96020 404 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ADORA2AP29274 412 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MAPK4P31152 587 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SFNP31947 248 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SETDB1Q15047 1291 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DYMQ7RTS9 669 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GPBP1Q86WP2 473 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DDX12PQ92771 950 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 LXNQ9BS40 222 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 EXOC1Q9NV70 894 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SAMM50Q9Y512 469 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.71□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SMTNL1A8MU46 457 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 WDR64B1ANS9 1081 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 IKBKBO14920 756 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 COBLO75128 1261 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ECEL1O95672 775 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SP2Q02086 613 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 UNC13DQ70J99 1090 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RDM1Q8NG50 284 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DONSONQ9NYP3 566 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ASB14A6NK59 587 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TM4SF4P48230 202 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GRB14Q14449 540 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FAM210AQ96ND0 272 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NACC1Q96RE7 527 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.71□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CREB3O43889 395 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SORBS3O60504 671 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NAT1P18440 290 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CYP11B2P19099 503 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ARSHQ5FYA8 562 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZIC5Q96T25 663 aa6.7□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms