RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PGK2P07205 417 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 KIF18AQ8NI77 898 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 MAP7D2Q96T17 732 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PORCNQ9H237 461 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 EFCC1Q9HA90 598 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.28■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 COBLO75128 1261 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PSMC5P62195 406 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 FSTL1Q12841 308 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM47Q96LD4 638 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN18Q99952 460 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.27■■□□□ 1.16
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ZSCAN12O43309 604 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TTI2Q6NXR4 508 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 C4orf19Q8IY42 314 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PANX2Q96RD6 677 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PASKQ96RG2 1323 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 KIF20AO95235 890 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 KRT31Q15323 416 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SYCP1Q15431 976 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 RGMBQ6NW40 437 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FGD4Q96M96 766 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB39O15060 712 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TEX33O43247 280 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 30.1
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SUMO3-201ENST00000332859 GAP43P17677 238 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF592Q92610 1267 aa22.25■■□□□ 1.15
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SUMO3-201ENST00000332859 THAP9Q9H5L6 903 aa22.25■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 KCNJ18B7U540 433 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 KCNJ12Q14500 433 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN21Q16825 1174 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CENPPQ6IPU0 288 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 UGCGQ16739 394 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC51Q96ER9 411 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.24■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 STRNO43815 780 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FAM13AO94988 1023 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TGFB3P10600 412 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GUCY2CP25092 1073 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ACTR2P61160 394 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SP2Q02086 613 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM14Q14142 442 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC41Q15345 812 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SFR1Q86XK3 245 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 MORC4Q8TE76 937 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.23■■□□□ 1.15
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