RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARVGQ9HBI0 331 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASTN1O14525 1302 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC5P62195 406 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STXBP2Q15833 593 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNGA4Q8IV77 575 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP6O43182 974 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX10O60683 326 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFAP3LO75121 409 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPM1P09493 284 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ICAM3P32942 547 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP1BP68106 108 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP135Q66GS9 1140 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B4DLN1 442 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAF5O00463 557 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNA14O95837 355 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDNRBP24530 442 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TERF1P54274 439 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTN2Q02246 1040 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE4BO95155 1302 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXD13P35453 343 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARRES1P49788 294 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAN2A1Q16706 1144 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PADI6Q6TGC4 694 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEB2H3BUK9 544 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDXKO00764 312 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYBP10242 640 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERCC3P19447 782 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FECHP22830 423 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP14P31944 242 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UGCGQ16739 394 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYCT1Q8N699 235 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FIZ1Q96SL8 496 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIPINQ9BVW5 301 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPK7Q13164 816 aa24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWA3BQ502W6 1294 aa24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID2Q68CP9 1835 aa24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCNT3O95395 438 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RETREG2Q8NC44 543 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA3Q9UL41 463 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP27XA6NNY8 438 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SFI1A8K8P3 1242 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAW1Q8N136 415 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP58Q9BVL2 599 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDST4Q9H3R1 872 aa24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCP110O43303 1012 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIP1RO75146 1068 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCDQ96DY2 449 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSAPP07602 524 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FIGNQ5HY92 759 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms