RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GCNT3O95395 438 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 POLR2MP0CAP2 368 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 UCHL3P15374 230 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TNFRSF8P28908 595 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GYS2P54840 703 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CYP4A11Q02928 519 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PPP2R5CQ13362 524 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GBP6Q6ZN66 633 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SLX4Q8IY92 1834 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087X0T9 212 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM228BP0C875 321 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ASTN1O14525 1302 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G6O60733 806 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PALMO75781 387 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM13AO94988 1023 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PON1P27169 355 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PRKCIP41743 596 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 KCND2Q9NZV8 630 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 STIM2Q9P246 746 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 UBE4BO95155 1302 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 EML1O00423 815 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYND10O75800 440 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PSMD10O75832 226 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP3O75969 853 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 KLRC1P26715 233 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ARID5AQ03989 594 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SLC5A5Q92911 643 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MYH10P35580 1976 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CES2O00748 559 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 NCK2O43639 380 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CXCR5P32302 372 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 EPHA7Q15375 998 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 EMBQ6PCB8 327 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 VPS36Q86VN1 386 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RGL1Q9NZL6 768 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RNF40O75150 1001 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CFBP00751 764 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RSPH10BP0C881 870 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9A1P19634 815 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 EPHB4P54760 987 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 APBA1Q02410 837 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf74Q6P047 294 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM151AQ8WW52 585 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PPIP5K2O43314 1243 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FLOT1O75955 427 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SLITRK3O94933 977 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MYBL2P10244 700 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ACTN2P35609 894 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PRELPP51888 382 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PTK2Q05397 1052 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM160B2Q86V87 743 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35C1Q96A29 364 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PSMB7Q99436 277 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PARVGQ9HBI0 331 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 EP400Q96L91 3159 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SPDYE6P0CI01 402 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN26Q16670 478 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 NACC1Q96RE7 527 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms