RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PPP2R2AP63151 447 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L24Q0WX57 530 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PICALMQ13492 652 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ARSHQ5FYA8 562 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 POTEGQ6S5H5 508 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 DAAM2Q86T65 1068 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 MED24O75448 989 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SLURP2P0DP57 97 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 AKR1B1P15121 316 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SMTNP53814 917 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PSMC6P62333 389 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 NYXQ9GZU5 481 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.31□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L10C9JJH3 530 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CLIC2O15247 247 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RASSF9O75901 435 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SMARCA1P28370 1054 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CASP4P49662 377 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 DDR1Q08345 913 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 9
ZNF3-202ENST00000299667 SEPT2Q15019 361 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 KCTD1Q719H9 257 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CEP57Q86XR8 500 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 TLDC2A0PJX2 215 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SMIM23A6NLE4 172 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.925e-8■■□□□ 11.9
ZNF3-202ENST00000299667 CHUKO15111 745 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 GFPT2O94808 682 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CLSTN1O94985 981 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 H2AFZP0C0S5 128 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CDR1P51861 262 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 BIRC3Q13489 604 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 H2AFVQ71UI9 128 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 FLOT1O75955 427 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 AKAP3O75969 853 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 FGGP02679 453 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ABCB4P21439 1286 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RFC4P35249 363 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 HOXD13P35453 343 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 NT5C2P49902 561 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 GALCP54803 685 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 RHBDL3P58872 404 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 KCNA1Q09470 495 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SFR1Q86XK3 245 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CUL5Q93034 780 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 GOPCQ9HD26 462 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PNMA2Q9UL42 364 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 LAMB2P55268 1798 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SFI1A8K8P3 1242 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 CES2O00748 559 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 OPLAHO14841 1288 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 SHBGP04278 402 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms