RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 CABS1Q96KC9 395 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 MCM8Q9UJA3 840 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 DNM3Q9UQ16 869 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 GCNT3O95395 438 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 ARL8AQ96BM9 186 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 VEZTQ9HBM0 779 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 CEP104O60308 925 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 PLS1Q14651 629 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 PROM2Q8N271 834 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 RGL1Q9NZL6 768 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 GRIN2DO15399 1336 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 LAMB2P55268 1798 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-202ENST00000299543 FAM153BP0C7A2 387 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MYBP10242 640 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ARHGAP4P98171 946 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 FAM153CQ494X1 144 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 GJB7Q6PEY0 223 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 LAMB1P07942 1786 aa14.71□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 FNTAP49354 379 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 KCNA1Q09470 495 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 SNHG28P0DPA3 235 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 PTK2Q05397 1052 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CRY2Q49AN0 593 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ARSHQ5FYA8 562 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 KSR1Q8IVT5 923 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 COA1Q9GZY4 146 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 BCS1LQ9Y276 419 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CASP4P49662 377 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 EPHB4P54760 987 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 NEDD9Q14511 834 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 SLC18A3Q16572 532 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CFAP58Q5T655 872 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 RDH13Q8NBN7 331 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 REEP2Q9BRK0 252 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 RGL2O15211 777 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ICA1Q05084 483 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 IFT20Q8IY31 132 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 107
CTDP1-202ENST00000299543 SWAP70Q9UH65 585 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 TRIM37O94972 964 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 RPS6KA1Q15418 735 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 TPH2Q8IWU9 490 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 OPA1O60313 960 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CRKP46108 304 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ERMNQ8TAM6 284 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CEP63Q96MT8 703 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 F5H6K3 240 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ZBTB39O15060 712 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 GNA14O95837 355 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CFBP00751 764 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MYBL1P10243 752 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 KLRC3Q07444 240 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 MSL1Q68DK7 614 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 ZIM3Q96PE6 472 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 BACH1O14867 736 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 AP1G2O75843 785 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-202ENST00000299543 UPP2O95045 317 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms