RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296122.10

PPP1CB-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CB, Length 3,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-201ENST00000296122 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.52□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 NDST4Q9H3R1 872 aa14.52□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.52□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 KRT13P13646 458 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CCZ1BP86790 482 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RETREG2Q8NC44 543 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RDM1Q8NG50 284 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PANX2Q96RD6 677 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 AZI2Q9H6S1 392 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TUBB4AP04350 444 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 LBX2Q6XYB7 198 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 DNERQ8NFT8 737 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 IFT74Q96LB3 600 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MED15Q96RN5 788 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.51□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ATP2A1O14983 1001 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 VWA3BQ502W6 1294 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 A0A1W2PQC6 194 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MFAP3LO75121 409 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CETN1Q12798 172 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SPA17Q15506 151 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 KIAA1328Q86T90 577 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RPTORQ8N122 1335 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 BICD1Q96G01 975 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MMP19Q99542 508 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MAF1Q9H063 256 aa14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 HIP1RO75146 1068 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CETPP11597 493 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GBP3Q9H0R5 595 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 KIF5CO60282 957 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 EXOC3O60645 756 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 RSPH10BP0C881 870 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ALCAMQ13740 583 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SPAG5Q96R06 1193 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 INTS13Q9NVM9 706 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PDXKO00764 312 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 NEDD9Q14511 834 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CLIC2O15247 247 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GLG1Q92896 1179 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TIPINQ9BVW5 301 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MYBP10242 640 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CYP2J2P51589 502 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC42Q96M95 316 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 TMEM206Q9H813 350 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 UQCRHP07919 91 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.096e-6■■■□□ 16.3
PPP1CB-201ENST00000296122 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 GNG11P61952 73 aa14.48□□□□□ -0.09
PPP1CB-201ENST00000296122 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms