RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 TBCKQ8TEA7 893 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 C6orf229H3BNL8 230 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 LDHCP07864 332 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 PDE6BP35913 854 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 TXKP42681 527 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ERVK-9P63128 1117 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 TMC4Q7Z404 712 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF570Q96NI8 536 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 MXD3Q9BW11 206 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 MTFR1LQ9H019 292 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.9■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 GJA10Q969M2 543 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 ETAA1Q9NY74 926 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.89■■□□□ 1.9
PKDCC-201ENST00000294964 RHBDL3P58872 404 aa26.89■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 PDE4DQ08499 809 aa26.89■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.89■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.89■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 OR52Z1P0C646 297 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SLC1A4P43007 532 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 RIPK1Q13546 671 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 ISCUQ9H1K1 167 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GGA1Q9UJY5 639 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 FTCDO95954 541 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MYBP10242 640 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 ASIC1P78348 528 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 NDST4Q9H3R1 872 aa26.88■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GTF2IP78347 998 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 AGBL2Q5U5Z8 902 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC26Q8TAB7 109 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 AGAP11Q8TF27 550 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 GRID2IPA4D2P6 1211 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC197Q8NCU1 140 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 PALMO75781 387 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 AP1G2O75843 785 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC53A6NM62 1247 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 RHOBTB3O94955 611 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.891e-8■■■■□ 22.4
PKDCC-201ENST00000294964 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 SOGA3Q5TF21 947 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC45Q96CN5 670 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CHMP6Q96FZ7 201 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 PANK4Q9NVE7 773 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CHADLQ6NUI6 762 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DYMQ7RTS9 669 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 NEK8Q86SG6 692 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MDM1Q8TC05 714 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CCHCR1Q8TD31 782 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM9Q9C026 710 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 NEUROG2Q9H2A3 272 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 C6orf50Q9HD87 102 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 TNNC1P63316 161 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 RRAGAQ7L523 313 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 P2RX5Q93086 422 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.85■■□□□ 1.89
PKDCC-201ENST00000294964 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms