RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PSME3-201ENST00000293362 ELP3Q9H9T3 547 aa11.21□□□□□ -0.61
PSME3-201ENST00000293362 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.21□□□□□ -0.61
PSME3-201ENST00000293362 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.21□□□□□ -0.61
PSME3-201ENST00000293362 RCCD1A6NED2 376 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 LRRC53A6NM62 1247 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NDUFA10O95299 355 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CYP2J2P51589 502 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 USP14P54578 494 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SLC35F6Q8N357 371 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 A0A1W2PQC6 194 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 AKAP3O75969 853 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KCNJ6P48051 423 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CNTN2Q02246 1040 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SYT17Q9BSW7 474 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PXMP2Q9NR77 195 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KCND1Q9NSA2 647 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 USP20Q9Y2K6 914 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CETN3O15182 167 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CCP110O43303 1012 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 HIP1RO75146 1068 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 CCNE2O96020 404 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NR3C2P08235 984 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SLC9A1P19634 815 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PADI6Q6TGC4 694 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SULF1Q8IWU6 871 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 DRC1Q96MC2 740 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NACC1Q96RE7 527 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.2□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 IRF6O14896 467 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 DSG3P32926 999 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KCNH2Q12809 1159 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 EPHA7Q15375 998 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 WDR78Q5VTH9 848 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 DNAJC7Q99615 494 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PARVGQ9HBI0 331 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KIF5CO60282 957 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PPP1R2P41236 205 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 HERVK_113P62684 666 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 GJB7Q6PEY0 223 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 KIAA1328Q86T90 577 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NEK11Q8NG66 645 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 JADE2Q9NQC1 790 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ASTN1O14525 1302 aa11.19□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.18□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 ZNF263O14978 683 aa11.18□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 TGFB1I1O43294 461 aa11.18□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PSME3-201ENST00000293362 NR3C1P04150 777 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms