RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TMOD1P28289 359 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 GTF2IP78347 998 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DDAH1O94760 285 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TUBP50607 506 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ARMCX6Q7L4S7 300 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MYBL1P10243 752 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 RHBDL3P58872 404 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 RASA3Q14644 834 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KANK3Q6NY19 840 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SYT15Q9BQS2 421 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TFR2Q9UP52 801 aa23.88■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC7Q99615 494 aa23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.87■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DEUP1Q05D60 604 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PICK1Q9NRD5 415 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 USP17L3A6NCW0 530 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 USP17L4A6NCW7 530 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CALM1P0DP23 149 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CALM2P0DP24 149 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CALM3P0DP25 149 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 AOC3Q16853 763 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KIFAP3Q92845 792 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.86■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 BACH1O14867 736 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ASAP2O43150 1006 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 WFS1O76024 890 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 LCA5Q86VQ0 697 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MXD3Q9BW11 206 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FAM205CA6NFA0 338 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ2P63252 427 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KRT31Q15323 416 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CERS5Q8N5B7 392 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CENPTQ96BT3 561 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 OPTNQ96CV9 577 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SNED1Q8TER0 1413 aa23.85■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 GAKO14976 1311 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FLOT1O75955 427 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.419e-12■■■□□ 18
PITX1-201ENST00000265340 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 FLT1P17948 1338 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 RCCD1A6NED2 376 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 G3V3G9 751 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 GLI1P08151 1106 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PAFAH1B1P43034 410 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 POLE2P56282 527 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 STX17P56962 302 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 SESTD1Q86VW0 696 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 IFT43Q96FT9 208 aa23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PITX1-201ENST00000265340 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms