RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 NAA35Q5VZE5 725 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 KLRC1P26715 233 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CEP104O60308 925 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 BMP3P12645 472 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 AMNQ9BXJ7 453 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 IQCKQ8N0W5 287 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HAS1Q92839 578 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CCDC17Q96LX7 622 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 A0A087X0T9 212 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SHTN1A0MZ66 631 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ZBTB7AO95365 584 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 FAM228BP0C875 321 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 JAG1P78504 1218 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ARHGAP4P98171 946 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 GABPAQ06546 454 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 KCNMA1Q12791 1236 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CFAP58Q5T655 872 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TLR2O60603 784 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 GCNT3O95395 438 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SLC9A1P19634 815 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 EPHB4P54760 987 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 PSMC6P62333 389 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 KCNH2Q12809 1159 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 QPCTQ16769 361 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CNPY4Q8N129 248 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 BAP1Q92560 729 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CNKSR1Q969H4 720 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 A0A1B0GUL6 1792 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 FLT3P36888 993 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DGKZQ13574 1117 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 KSR1Q8IVT5 923 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 A0A1W2PQJ5 194 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ZBTB39O15060 712 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TMOD1P28289 359 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SKOR1P84550 965 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 IFT88Q13099 833 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DACT2Q5SW24 774 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 FZD1Q9UP38 647 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 PDIA5Q14554 519 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HGSNATQ68CP4 663 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SFR1Q86XK3 245 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DNM3Q9UQ16 869 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 NRAPQ86VF7 1730 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CASZ1Q86V15 1759 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 MED24O75448 989 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 SERPING1P05155 500 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ABCB4P21439 1286 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CASP5P51878 434 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 A0A1W2PRG0 241 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC5-201ENST00000264350 RSPH10BP0C881 870 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms