RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SPDL1Q96EA4 605 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MMS19Q96T76 1030 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EHD2Q9NZN4 543 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 KRT14P02533 472 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PRELPP51888 382 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SFR1Q86XK3 245 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SH2D4AQ9H788 454 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TRIM49P0CI25 452 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TRIM49CP0CI26 452 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ARHGAP4P98171 946 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PPP1R7Q15435 360 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ALX1Q15699 326 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GPR162Q16538 588 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MTERF2Q49AM1 385 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CFAP58Q5T655 872 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ARL8AQ96BM9 186 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 APOL6Q9BWW8 343 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GGT7Q9UJ14 662 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MUC3AQ02505 3323 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 POTEB2H3BUK9 544 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 WNT7AO00755 349 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CLTAP09496 248 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SMTNP53814 917 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SEMA3FQ13275 785 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PPP2R5DQ14738 602 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TCP11Q8WWU5 503 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MIEF2Q96C03 454 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NBPF3Q9H094 633 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NDST4Q9H3R1 872 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 BARHL2Q9NY43 387 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 C5orf42Q9H799 3197 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 OPLAHO14841 1288 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZBTB5O15062 677 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NDUFA10O95299 355 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FGFR2P21802 821 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TMOD1P28289 359 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CA8P35219 290 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CETN2P41208 172 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 STAT1P42224 750 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PSMD2Q13200 908 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MESDQ14696 234 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MGARPQ8TDB4 240 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ACER1Q8TDN7 264 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 KLC4Q9NSK0 619 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 INTS13Q9NVM9 706 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CAND2O75155 1236 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PEX3P56589 373 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GUCY2DQ02846 1103 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RPS6KA1Q15418 735 aa8.29□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms