RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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PDLIM4-201ENST00000253754 WRNIP1Q96S55 665 aa20.6■□□□□ 0.89
PDLIM4-201ENST00000253754 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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PDLIM4-201ENST00000253754 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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PDLIM4-201ENST00000253754 KIF20AO95235 890 aa20.59■□□□□ 0.89
PDLIM4-201ENST00000253754 GNA14O95837 355 aa20.59■□□□□ 0.89
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PDLIM4-201ENST00000253754 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.58■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 ASTN1O14525 1302 aa20.57■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 ACTN1P12814 892 aa20.57■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.57■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 JADE2Q9NQC1 790 aa20.57■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 GINM1Q9NU53 330 aa20.57■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.57■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.57■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 PPP2R5CQ13362 524 aa20.56■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 MTMR2Q13614 643 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.56■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 KSR1Q8IVT5 923 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 KLRG1Q96E93 195 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 GANQ9H2C0 597 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 DOCK1Q14185 1865 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 POTEB2H3BUK9 544 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDLIM4-201ENST00000253754 NR3C1P04150 777 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC9A1P19634 815 aa20.55■□□□□ 0.88
PDLIM4-201ENST00000253754 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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