RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN1Q05586 938 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMTC1Q8IUR5 882 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GBP3Q9H0R5 595 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RIC8AQ9NPQ8 531 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC37A2A6NM11 1700 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3CDO00329 1044 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG1Q07617 926 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TAPT1Q6NXT6 567 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 HDXQ7Z353 690 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE9A4FU28 777 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT4O43236 478 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SGPL1O95470 568 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NR3C2P08235 984 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCYAP1R1P41586 468 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE4DQ08499 809 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RBL2Q08999 1139 aa29.18■■■□□ 2.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL5Q93034 780 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 DESI2Q9BSY9 194 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SOWAHDA6NJG2 315 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY7P51828 1080 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PGM5Q15124 567 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT2P35908 639 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R18Q6NYC8 613 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE5Q96GU1 130 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MAF1Q9H063 256 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 BRMS1Q9HCU9 246 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC10BA6NIK2 292 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 DPYDQ12882 1025 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NR5A1Q13285 461 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN21Q16825 1174 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD9BQ6WBX8 426 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS20O76081 388 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NPY5RQ15761 445 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa29.16■■■□□ 2.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.16■■■□□ 2.26
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.14■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 IWS1Q96ST2 819 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 EPC1Q9H2F5 836 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LZTFL1Q9NQ48 299 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ARIH2O95376 493 aa29.13■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 MTF1Q14872 753 aa29.13■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa29.12■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.12■■■□□ 2.25
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CAPNS1-201ENST00000246533 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf50Q9HD87 102 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 RWDD2AQ9UIY3 292 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM21Q9UKJ8 722 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.11■■■□□ 2.25
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