RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXC11-201ENST00000243082 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
HOXC11-201ENST00000243082 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ASTN1O14525 1302 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 PRKG1Q13976 671 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.39■□□□□ 0.85
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HOXC11-201ENST00000243082 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 KIF5CO60282 957 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 GUCY2CP25092 1073 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K9P80192 1104 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 DLK2Q6UY11 383 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 BAP1Q92560 729 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SPON1Q9HCB6 807 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ATP9AO75110 1047 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 HERVK_113P62684 666 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ATP2A1O14983 1001 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TGFB1I1O43294 461 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NOL4O94818 638 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NR3C1P04150 777 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MAPK7Q13164 816 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 NEK11Q8NG66 645 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 AKAP3O75969 853 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 LYPLA2O95372 231 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 DAW1Q8N136 415 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SAMM50Q9Y512 469 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC53A6NM62 1247 aa20.35■□□□□ 0.85
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HOXC11-201ENST00000243082 NR3C2P08235 984 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 KRT83P78385 493 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 KCNH2Q12809 1159 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 PADI6Q6TGC4 694 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 RRAGAQ7L523 313 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 HIP1RO75146 1068 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 VGLL4Q14135 290 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 SLC35F6Q8N357 371 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MAP7D2Q96T17 732 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CLIC2O15247 247 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CCNE2O96020 404 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CCND2P30279 289 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 RARRES1P49788 294 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 ODR4Q5SWX8 454 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 PDXDC1Q6P996 788 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 KSR1Q8IVT5 923 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 STRA6Q9BX79 667 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 CEP72Q9P209 647 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.34■□□□□ 0.85
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