RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HBP1O60381 514 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ACRP10323 421 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM240Q5SV17 173 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 MCTP1Q6DN14 999 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TDHQ8IZJ6 230 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.614e-6■■□□□ 13.3
SYF2-201ENST00000236273 IL23AQ9NPF7 189 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 SELPP16109 830 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 IGBP1P78318 339 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 RETREG2Q8NC44 543 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.1■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 SYT1P21579 422 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TXKP42681 527 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 MBTPS1Q14703 1052 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 RPAINQ86UA6 219 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 MARCH6O60337 910 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 THPOP40225 353 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 EPHA7Q15375 998 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF365Q70YC5 407 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 HSCBQ8IWL3 235 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 BANK1Q8NDB2 785 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CEP89Q96ST8 783 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 NBNO60934 754 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 OATP04181 439 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 KLRC1P26715 233 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PRKCEQ02156 737 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 COL1A2P08123 1366 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 EVPLQ92817 2033 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 FAM26DQ5JW98 314 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RASIP1Q5U651 963 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RGL1Q9NZL6 768 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TMEM150BA6NC51 233 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CAND2O75155 1236 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SLITRK3O94933 977 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 C22orf31O95567 290 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CXCL10P02778 98 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 OR52Z1P0C646 297 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PDCP20941 246 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RFC2P35250 354 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PSMC5P62195 406 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TCTN1Q2MV58 587 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 FAM167AQ96KS9 214 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA1P02708 482 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RSPH10BP0C881 870 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 MGAT3Q09327 533 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PTGDRQ13258 359 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 XKR3Q5GH77 459 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 DYDC2Q96IM9 177 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 MTMR6Q9Y217 621 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SZT2Q5T011 3432 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 POTEMA6NI47 508 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 FGBP02675 491 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 IL17AQ16552 155 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 ANO5Q75V66 913 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 FERMT3Q86UX7 667 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 HERVK_113Q902F9 699 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SIP14410 1827 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms