RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CACNA1HO95180 2353 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM221A6NGB7 291 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 M0R296 226 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMP1P03956 469 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCG2P13521 617 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFNAR1P17181 557 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEDD9Q14511 834 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NTRK3Q16288 839 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 METTL7BQ6UX53 244 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BARHL2Q9NY43 387 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPLX1O14810 134 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPFIA3O75145 1194 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHRNA1P02708 482 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAM15Q13444 863 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD1Q15327 319 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IER5LQ5T953 404 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR20Q99678 358 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRRX2Q99811 253 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLVAPQ9BX97 442 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMCO2A6NFE2 343 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADCY7P51828 1080 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AK2P54819 239 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAM17P78536 824 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PKN1Q16512 942 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIOO75962 3097 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ENPP3O14638 875 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ST18O60284 1047 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STAM2O75886 525 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ICAM3P32942 547 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEK4P51957 841 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SP4Q02446 784 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NRCAMQ92823 1304 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EYA4O95677 639 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAMK1Q14012 370 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LPIN1Q14693 890 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RSPH3Q86UC2 560 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C5orf42Q9H799 3197 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FIBPO43427 364 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DGKIO75912 1065 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZXDAP98168 799 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCRN1Q12765 414 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEMA3FQ13275 785 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EFHBQ8N7U6 833 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 P2RX5Q93086 422 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLEC1BQ9P126 229 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ITGB1P05556 798 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCF15Q12870 199 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXL6Q8N531 539 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C6orf50Q9HD87 102 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC3P53804 2025 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ESYT2A0FGR8 921 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.52■■□□□ 1.04
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