RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LIFR	P42702	1097 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ANTXR2	P58335	489 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FGD4	Q96M96	766 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MRC1	P22897	1456 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PQC6	194 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SCG2	P13521	617 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MMP14	P50281	582 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PICALM	Q13492	652 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	HSD17B3	P37058	310 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DPYD	Q12882	1025 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TMED1	Q13445	227 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3	2e-6	■■■■■ 109.7
PXN-222	ENST00000637624	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	KLC1	Q07866	573 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NEDD4	P46934	1319 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CCND1	P24385	295 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PHKA1	P46020	1223 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GYG1	P46976	350 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DR1	Q01658	176 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	GNA11	P29992	359 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PBK	Q96KB5	322 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	STAT1	P42224	750 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SKOR1	P84550	965 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CYTH2	Q99418	400 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PLCG1	P19174	1290 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	BCAM	P50895	628 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	DDR1	Q08345	913 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	ADD2	P35612	726 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	RCN2	Q14257	317 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	TTI1	O43156	1089 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	SERPING1	P05155	500 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PXN-222	ENST00000637624	IL9R	Q01113	521 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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