RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MARK3P27448 753 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RBL2Q08999 1139 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLCB4Q15147 1175 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TET1Q8NFU7 2136 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HAS1Q92839 578 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GLG1Q92896 1179 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SNX21Q969T3 373 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VWCEQ96DN2 955 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SETD4Q9NVD3 440 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.61□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 WDR64B1ANS9 1081 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PITPNM1O00562 1244 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TBX3O15119 743 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TREHO43280 583 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CSF2RAP15509 400 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP4AP20648 1035 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 STAT5BP51692 787 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCL23P55773 120 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FPGSQ05932 587 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTK7Q13308 1070 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SERINC5Q86VE9 423 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCLYQ96I15 445 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM20AQ96MK3 541 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AZI2Q9H6S1 392 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF302Q9NR11 478 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DISC1Q9NRI5 854 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VAV3Q9UKW4 847 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NOD1Q9Y239 953 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIF3AQ9Y496 699 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EVPLQ92817 2033 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARID2Q68CP9 1835 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NRCAMQ92823 1304 aa11.6□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A1W2PPC1 479 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BACH1O14867 736 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHMP2AO43633 222 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF862O60290 1169 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PSAPP07602 524 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 INSRRP14616 1297 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SFNP31947 248 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SLC26A2P50443 739 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 JAK3P52333 1124 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPFIA1Q13136 1202 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GRIK4Q16099 956 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UGCGQ16739 394 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM199Q8N511 208 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CAGE1Q8TC20 777 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.59□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTPRSQ13332 1948 aa11.58□□□□□ -0.55
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 POTEB3A0JP26 581 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EML1O00423 815 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IQCF3P0C7M6 154 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CKBP12277 381 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP2B1P20020 1258 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPP2R5CQ13362 524 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BFSP2Q13515 415 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GPNMBQ14956 572 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SHHQ15465 462 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 POTEBQ6S5H4 581 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TDHQ8IZJ6 230 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RDM1Q8NG50 284 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MTMR9Q96QG7 549 aa11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms