RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ADAM17P78536 824 aa25.26■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 RTN1Q16799 776 aa25.26■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 KCNB2Q92953 911 aa25.26■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 TREHO43280 583 aa25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB43O43298 467 aa25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 CTSHP09668 335 aa25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 POTEB3A0JP26 581 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 NCK2O43639 380 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 ATP9AO75110 1047 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 UPP2O95045 317 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 POTEBQ6S5H4 581 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.24■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 NID2Q14112 1375 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 GNAT1P11488 350 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 MRE11P49959 708 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 MTMR1Q13613 665 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 JADE2Q9NQC1 790 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 CLDND1Q9NY35 253 aa25.23■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 MAFGO15525 162 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 SP4Q02446 784 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 NHLH1Q02575 133 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 RPAINQ86UA6 219 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 SETD4Q9NVD3 440 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.22■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 NRCAMQ92823 1304 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 STXBP3O00186 592 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 CTNNB1P35222 781 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 NAPAP54920 295 aa25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SRRT-218ENST00000620394 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CDC27P30260 824 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 HSPA4P34932 840 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 FIBCD1Q8N539 461 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 FBXL18Q96ME1 805 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 BARHL2Q9NY43 387 aa25.2■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 RB1P06400 928 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ADCY7P51828 1080 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 FAM26DQ5JW98 314 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 FBXL16Q8N461 479 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 IL17RAQ96F46 866 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ANO3Q9BYT9 981 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP4P98171 946 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 AP3B2Q13367 1082 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.18■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 NFASCO94856 1347 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 IRS1P35568 1242 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 LTBRP36941 435 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SREBF1P36956 1147 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 MYO7AQ13402 2215 aa25.17■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 PPFIA1Q13136 1202 aa25.16■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.16■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.16■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SMCO2A6NFE2 343 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 LINC00271P0C7V0 271 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CPA1P15085 419 aa25.15■■□□□ 1.62
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