RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 EMC10Q5UCC4 262 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 WHAMMQ8TF30 809 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SIK1P57059 783 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MEA1Q16626 185 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RRAGAQ7L523 313 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PSMD1Q99460 953 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FAM196BA6NMK8 535 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MYL1P05976 194 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RIPK1Q13546 671 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 HPS3Q969F9 1004 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PREBQ9HCU5 417 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 EXOC1Q9NV70 894 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PRDX5P30044 214 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ECHS1P30084 290 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH3A1P30838 453 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 STAT6P42226 847 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ATP11AP98196 1134 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MREGQ8N565 214 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TNKSO95271 1327 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK3O14649 394 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CEP104O60308 925 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 HIP1RO75146 1068 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ETS2P15036 469 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF8P28908 595 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 COPB2P35606 906 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ERFP50548 548 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ADCY1Q08828 1119 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCNJLQ8IV13 435 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 AMACRQ9UHK6 382 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PP2D1A8MPX8 630 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ITGA4P13612 1032 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CACNB3P54284 484 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SOGA3Q5TF21 947 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ARL10Q8N8L6 244 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ESR2Q92731 530 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GJA10Q969M2 543 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SHISA4Q96DD7 197 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms