RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRC24Q50LG9 513 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 C12orf40Q86WS4 652 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM122AQ96E09 287 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDCA5Q96FF9 252 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 BRCA2P51587 3418 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPEF2Q9C093 1822 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CACNA1FO60840 1977 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 E2F8A0AVK6 867 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAN1A2O60476 641 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 BRINP1O60477 761 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYP11A1P05108 521 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGFR3P22607 806 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 NF2P35240 595 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDE3AQ14432 1141 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF460Q14592 562 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 POU4F3Q15319 338 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 DHCR24Q15392 516 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 BRAPQ7Z569 592 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 COG1Q8WTW3 980 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGD4Q96M96 766 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC6A18Q96N87 628 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SIL1Q9H173 461 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF16BQ96L93 1317 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYH3P11055 1940 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 WNT10BO00744 389 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYO1BO43795 1136 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 BCAR3O75815 825 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGFR1P11362 822 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 IL1R1P14778 569 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP2K2P36507 400 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR20EP86478 221 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR20CP86479 221 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR20DP86480 221 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR20BP86481 221 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR20AP86496 221 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CTBSQ01459 385 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRKG1Q13976 671 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 RGMBQ6NW40 437 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM192Q8IY95 271 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CERS5Q8N5B7 392 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CNTD1Q8N815 330 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM13CQ8NE31 585 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP7Q93009 1102 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 OSBP2Q969R2 916 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTC1Q99614 292 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 HAUS7Q99871 368 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCN9AQ15858 1988 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLRN2A0PK11 232 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC189A1A4V9 331 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 H3BRJ5 948 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF862O60290 1169 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDE8BO95263 885 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPTXRO95502 500 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 JMJD7P0C870 316 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms