RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJB1P08034 283 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMC6P62333 389 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EPHA7Q15375 998 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT79Q5XKE5 535 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEGQ6S5H5 508 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP49Q70CQ1 688 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPH2Q8IWU9 490 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNS4Q8IZW8 715 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EPSTI1Q96J88 318 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCYT2Q99447 389 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LXNQ9BS40 222 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EMSYQ7Z589 1322 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A087WWV3 80 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MED24O75448 989 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXLNAP40222 546 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBA7P41226 1012 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOX10P56693 466 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKCEQ02156 737 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABHD8Q96I13 439 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPC6Q9Y210 931 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM150BA6NC51 233 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJA8P48165 433 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSEN2P49810 448 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAT5BP51692 787 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACLYP53396 1101 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFSD10Q14728 455 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SHC4Q6S5L8 630 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDILTQ8N807 584 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RDM1Q8NG50 284 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PANK2Q9BZ23 570 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PQY0 241 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BRB1 525 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNM1LO00429 736 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPFIA4O75335 1185 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LGR5O75473 907 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATG7O95352 703 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGBP1P78318 339 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDIA5Q14554 519 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ECM1Q16610 540 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FSIP1Q8NA03 581 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEK9Q8TD19 979 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CALML4Q96GE6 196 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AK8Q96MA6 479 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1B0GVL5 298 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF862O60290 1169 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 F2P00734 622 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OATP04181 439 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLCG1P19174 1290 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMC5P62195 406 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KAT2BQ92831 832 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms