RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 DEFB118Q96PH6 123 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 NEK1Q96PY6 1258 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 ACAD9Q9H845 621 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 LY9Q9HBG7 655 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 BRD7Q9NPI1 651 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLK14Q9P0G3 267 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 FBXO40Q9UH90 709 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 ALPK3Q96L96 1907 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-240ENST00000613995 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARHGEF15O94989 841 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 GJB1P08034 283 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CASTP20810 708 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 HSPA4P34932 840 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KRT32Q14532 448 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TKFCQ3LXA3 575 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 COX20Q5RI15 118 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 NSMFQ6X4W1 530 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 HOMER1Q86YM7 354 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MAML3Q96JK9 1138 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP26Q9BXU7 913 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MAD2L2Q9UI95 211 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 RPTORQ8N122 1335 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KAT6AQ92794 2004 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 NFIBO00712 420 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 DDAH1O94760 285 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARAFP10398 606 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CALML3P27482 149 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KIF5BP33176 963 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CNTN2Q02246 1040 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TROAPQ12815 778 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MYO9BQ13459 2157 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ANO1Q5XXA6 986 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 C16orf46Q6P387 395 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 Q6ZUG5 572 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MICU3Q86XE3 530 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 FBXO11Q86XK2 927 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMTC2Q8N394 836 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRPV1Q8NER1 839 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCNB2Q92953 911 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 SHISA4Q96DD7 197 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIGSQ96S52 555 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 TINF2Q9BSI4 451 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 USTQ9Y2C2 406 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PFASO15067 1338 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZBTB5O15062 677 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZBTB43O43298 467 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 OIP5O43482 229 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CYTH3O43739 400 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 SGPL1O95470 568 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CALM1P0DP23 149 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-240ENST00000613995 CALM2P0DP24 149 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms