RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX17Q15036 470 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP55Q53EZ4 464 aa14.13□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM161BQ96MY7 647 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.13□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.12□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD10Q14728 455 aa14.12□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 C7orf31Q8N865 590 aa14.12□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.12□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 PSEN2P49810 448 aa14.11□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.11□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.09□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.09□□□□□ -0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC192P0DO97 292 aa14.09□□□□□ -0.15
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