RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BICD2Q8TD16 824 aa27.45■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRPC6Q9Y210 931 aa27.41■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.38■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KAT6AQ92794 2004 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TOP1MTQ969P6 601 aa27.37■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MICAL3Q7RTP6 2002 aa27.36■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.36■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MYO9BQ13459 2157 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HBP1O60381 514 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERVK-21P61565 698 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.35■■□□□ 1.97
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