RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 NUP98P52948 1817 aa6.09□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 MEIS1O00470 390 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 IGKV5-2P06315 115 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PDE6BP35913 854 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 BNIP3Q12983 259 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 IKZF1Q13422 519 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 GAB4Q2WGN9 574 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PARP10Q53GL7 1025 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 OLFM4Q6UX06 510 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CREG2Q8IUH2 290 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 TTLL6Q8N841 843 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 BVESQ8NE79 360 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SLX4Q8IY92 1834 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PCNTO95613 3336 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 WASH4PA8MWX3 477 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 H0YIN7 160 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 NPR1P16066 1061 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SLFN5Q08AF3 891 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 LRP8Q14114 963 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PPP2R5DQ14738 602 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 FLCNQ8NFG4 579 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 MASTLQ96GX5 879 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 AKT3Q9Y243 479 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 COL4A5P29400 1685 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 H0Y8X5 98 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ESR1P03372 595 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 BMP8BP34820 402 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CTSKP43235 329 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ST5P78524 1137 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 POU4F1Q01851 419 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 EGR3Q06889 387 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 GRB10Q13322 594 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SGSM3Q96HU1 749 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 NYXQ9GZU5 481 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PIF1Q9H611 641 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 WNT11O96014 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ITGAVP06756 1048 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SYPP08247 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CD8BP10966 210 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CD96P40200 585 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 AMPD2Q01433 879 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 KSR2Q6VAB6 950 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SPATC1Q76KD6 591 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SPRED2Q7Z698 418 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 FAM89AQ96GI7 184 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 DNAJC7Q99615 494 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 TCFL5Q9UL49 500 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 CHD4Q14839 1912 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 ABCC4O15439 1325 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 KCNH1O95259 989 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-211ENST00000574728 VAV1P15498 845 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms